# Sequence analysis (signal): # Length [bp]: 1250.08 +/- 376.841 # GC-content [%]: 40.088 +/- 5.10573 # Nucleotide composition: # A: 0.282798 +/- 0.035911 # T: 0.279296 +/- 0.0457773 # C: 0.196237 +/- 0.0304972 # G: 0.204643 +/- 0.0316567 # Model: 5-fold cross-validation, excluding PRIORITY and MARKOV features: Estimated AUC (lower bound) = 0.83 TPR at 5% FPR = 0.26 Type: LASSO Minimum fraction = 0.52 Number of features used: 111 Total number of features: 711 Descriptive features: INDEX WEIGHT MOTIF V$WT1_Q6 580 1009.55 MOTIF V$AP2_Q6 133 664.94 MOTIF V$MINI19_B 228 583.48 MOTIF V$AP4_Q6_01 474 467.4 MOTIF V$J3_NFYA_ 640 432.29 MOTIF V$CHCH_01 516 390.39 MOTIF V$UF1H3BETA_Q6 558 355.74 MOTIF V$MYOD_Q6_01 476 348.31 MOTIF V$WHN_B 236 330.86 MOTIF V$AP2ALPHA_01 307 220.66 MOTIF V$E2F_Q2 452 216.5 MOTIF V$LBP1_Q6 366 162.79 MOTIF V$PAX8_B 233 157.38 MOTIF V$AR_Q6 495 147.57 MOTIF V$RBPJK_01 576 139.79 MOTIF V$RFX1_02 204 137.71 MOTIF V$LEF1_Q2_01 540 117.19 MOTIF V$PAX4_03 253 111.94 MOTIF V$SOX17_01 536 99.68 MOTIF V$E2F1_Q3_01 482 99.25 MOTIF V$OCT1_03 98 90.92 MOTIF V$J3_RORA_1_HSAP 650 90.81 MOTIF V$IPF1_Q4 284 87.44 MOTIF V$J3_BAPX1_MMUS 690 86.88 MOTIF V$SPZ1_01 288 84.64 MOTIF V$TAL1BETAE47_01 38 76.76 MOTIF V$CRX_Q4 355 73.21 MOTIF V$OCT1_B 243 71.12 MOTIF V$GATA1_03 88 63.77 MOTIF V$MEIS1_01 270 60.74 MOTIF V$J3_SOX9_HSAP 656 55.61 MOTIF V$GFI1B_01 555 51.25 MOTIF V$OCT1_04 99 41.27 MOTIF V$ELF1_Q6 417 38.69 MOTIF V$J3_MYF_HSAP 635 36.63 MOTIF V$E2F_Q6_01 468 35.2 MOTIF V$ZIC2_01 291 31.89 MOTIF V$OCT_Q6 445 30.88 MOTIF V$PXRRXR_02 600 26.46 MOTIF V$OCT4_01 585 22.84 MOTIF 9_PRIORITY 710 21.26 MOTIF V$PAX6_01 63 20.77 MOTIF V$MOVOB_01 570 14.88 MOTIF V$J3_LHX3_MMUS 698 13.3 MOTIF V$POU1F1_Q6 416 10.86 MOTIF V$MEF2_01 6 8.82 MOTIF V$PTF1BETA_Q6 375 8.61 MOTIF V$LMAF_Q2 590 7.99 MOTIF V$NANOG_01 583 7.12 MOTIF V$CEBP_Q2 134 6.74 MOTIF V$NKX25_02 173 6.53 MOTIF 4_PRIORITY 705 6.31 MOTIF V$GEN_INI2_B 219 5.28 MOTIF V$ZIC3_01 292 5.01 MOTIF V$J3_T_MMUS 606 2.66 MOTIF V$PXR_Q2 497 -0.85 MOTIF V$ATATA_B 217 -1.47 MOTIF V$NFKAPPAB65_01 28 -3 MOTIF V$MYB_Q5_01 462 -3.15 MOTIF V$FOXO3A_Q1 588 -5.71 MOTIF V$TEF_Q6 379 -8.63 MOTIF V$AR_02 487 -9.5 MOTIF V$TAACC_B 235 -10.52 MOTIF V$ETS_Q4 431 -10.97 MOTIF V$AP2ALPHA_03 554 -11.01 MOTIF V$FAC1_01 296 -13.63 MOTIF V$HNF4ALPHA_Q6 362 -13.79 MOTIF V$SEF1_C 152 -14.83 MOTIF V$J3_TCF11-MAFG_GGAL 665 -16.71 MOTIF V$CDP_02 68 -18.38 MOTIF V$TEL2_Q6 380 -21.53 MOTIF V$FXR_IR1_Q6 428 -24.47 MOTIF V$COUP_01 113 -25.18 MOTIF V$PEA3_Q6 374 -25.21 MOTIF V$P53_01 17 -26.58 MOTIF V$GATA_C 144 -26.61 MOTIF V$TCF11MAFG_01 205 -30.6 MOTIF V$PR_01 488 -36 MOTIF V$J3_MYC-MAX_HSAP 639 -37.91 MOTIF V$PADS_C 150 -39.09 MOTIF V$PU1_Q6 376 -39.39 MOTIF V$HTF_01 348 -43.62 MOTIF V$IRF2_01 37 -43.71 MOTIF V$AREB6_02 265 -46.82 MOTIF V$ELK1_01 7 -48.62 MOTIF V$MYB_Q3 433 -50.77 MOTIF V$J3_GATA3_HSAP 622 -52.86 MOTIF V$STAT5B_01 298 -59.29 MOTIF V$LMO2COM_02 201 -59.79 MOTIF V$STAT6_02 334 -69.61 MOTIF V$GR_01 489 -71.65 MOTIF V$NFKB_Q6 138 -73.74 MOTIF V$XBP1_01 182 -82.01 MOTIF V$AIRE_02 524 -86.34 MOTIF V$USF_Q6_01 446 -96.24 MOTIF V$GATA3_03 249 -100.12 MOTIF V$CETS1P54_02 46 -100.91 MOTIF V$J3_ZNF354_HSAP 693 -103.13 MOTIF V$PPARA_01 174 -110.85 MOTIF V$SP1_Q6 140 -111.03 MOTIF V$STAT5A_01 297 -119.84 MOTIF V$CDXA_01 66 -121.11 MOTIF V$TBX5_02 539 -121.53 MOTIF V$MUSCLE_INI_B 226 -134.46 MOTIF V$GR_Q6_01 469 -135.15 MOTIF V$J3_REST_HSAP 701 -144.11 MOTIF V$TITF1_Q3 282 -157.19 MOTIF V$CREB_Q2_01 464 -169.13 MOTIF V$LFA1_Q6 367 -180.39 MOTIF V$USF_C 155 -241.95 MOTIF V$J3_ROAZ_RNOR 687 -765.1